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研究人員開發(fā)聚焦離子束(FIB)減薄樣品過程中三維實(shí)時(shí)定位方法

2023-08-21 10:42:16     來(lái)源:網(wǎng)絡(luò)


【資料圖】

清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李雪明課題組在《Journal of Structural Biology》期刊發(fā)表了題為“Locating cellular contents during cryoFIB milling using cellular secondary-electron imaging”的研究論文。該論文利用細(xì)胞二次電子成像(CESI)技術(shù),解決了聚焦離子束(FIB)切割樣品中的定位問題(圖1)。該技術(shù)基于雙束電鏡中掃描電鏡基本的成像方式,無(wú)需額外的設(shè)備,樣品也無(wú)需經(jīng)過任何處理即可實(shí)現(xiàn)。該工作討論了CSEI技術(shù)的成像原理,優(yōu)化了CSEI的成像設(shè)置,使其可在主流的雙束電鏡上應(yīng)用,并且經(jīng)過測(cè)試,該方法在不同的切割條件下都是可信賴的。

圖1:CESI技術(shù)的工作流程

冷凍電子斷層成像技術(shù)(cryoET)是一項(xiàng)受到廣泛關(guān)注地可以直接在組織或者細(xì)胞原位研究生物大分子結(jié)構(gòu)的技術(shù)。FIB因能夠提供近乎無(wú)損的樣品減薄方式而成為了cryoET最常用的樣品制備方法。然而,如何在FIB減薄樣品的過程中定位目標(biāo)區(qū)域一直是一個(gè)難題。

研究團(tuán)隊(duì)針對(duì)FIB減薄樣品過程中的定位問題,想要開發(fā)一種容易操作、普適性的方法。受到層掃技術(shù)的啟發(fā),研究團(tuán)隊(duì)想到利用掃描電鏡所成的高襯度的圖像進(jìn)行定位。在冷凍狀態(tài)下,掃描電鏡主要利用二次電子進(jìn)行成像,在默認(rèn)狀態(tài)下,二次電子像被用來(lái)觀察樣品的形貌(圖2a),輔助切割。而對(duì)于FIB切割出來(lái)的平面,二次電子像只能看到模糊的細(xì)菌輪廓(圖2b)。為此,該工作對(duì)于二次電子像的成像原理進(jìn)行探究,并對(duì)影響二次電子像成像的因素進(jìn)行了一一測(cè)試,包括電壓加速、電流、探測(cè)器、成像模式、駐留時(shí)間、工作距離、掃描次數(shù)等。最終,總結(jié)出了在市面上主流FIB中都適用的參數(shù),使得不同儀器上的二次電子像都能有很好的襯度(圖3)。

圖2:默認(rèn)狀態(tài)下利用掃描電鏡觀察樣品形貌(左)與FIB減薄后的平面(右)

圖3:大腸桿菌細(xì)胞使用不同F(xiàn)IB設(shè)備成細(xì)胞二次電子像均能有很好的襯度

為了驗(yàn)證利用CESI技術(shù)進(jìn)行定位的可行性,該工作將CESI技術(shù)應(yīng)用到不同類型的樣品上,包括細(xì)菌、單細(xì)胞真核生物衣藻、人皮膚鱗癌細(xì)胞、海拉細(xì)胞、和動(dòng)、植物組織(圖4),發(fā)現(xiàn)均能有很好的成像效果。同時(shí),研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在不同切割的條件下,包括在樣品表面有冰渣的情況下以及大束流的切割條件下,不會(huì)影響CSEI技術(shù)的使用。

圖4:不同類型的樣品在CSEI技術(shù)下的成像效果

最后,該研究以衣藻的基體(basal body)為定位對(duì)象,建立了簡(jiǎn)單的切割-定位流程。使用CSEI技術(shù)定位時(shí),從樣品單側(cè)進(jìn)行減薄,每次FIB減薄后,都使用CSEI技術(shù)進(jìn)行定位。CSEI技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)在切割過程中進(jìn)行持續(xù)實(shí)時(shí)成像和精確三維定位。

清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李雪明副教授為本文通訊作者。清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院2018級(jí)博士生林超(已畢業(yè))、生命學(xué)院博士后張立、生命學(xué)院2021級(jí)博士生張子穎、蔡司顯微鏡北京客戶中心工程師蔣藝豐為該論文的共同第一作者。清華大學(xué)博士研究生王思涵(已畢業(yè)),清華大學(xué)周珩博士、趙雅嫻博士,潘俊敏教授實(shí)驗(yàn)室博士研究生王正茂,李丕龍副教授實(shí)驗(yàn)室李如博士為本工作提供了細(xì)胞樣品;李曉敏博士和李英博士為樣品制備和數(shù)據(jù)收集提供的大力支持。本工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金、清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心、北京生物結(jié)構(gòu)前沿中心和結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心的資助。

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